大明皇家科學研究所，坐落在南京西郊，位於雨花臺以南至將軍山之中。這個位置選的甚妙，如果朱怡成拿著後世的地方比較的話就能發現，所選研究所的位置同後世的南京科技館幾乎重合。

名稱雖只是研究所，但其佔地極大，並且為保密，研究所築著高高的圍牆，還有精兵把守，從外表來看，幾乎和個小城沒什麼兩樣。

而在其內，更有不同的區域和建築劃分，從大的來看，分別有核心區域（主要是研究室、實驗室、行政辦公等等），工廠區（為進行實用和實驗性質的各小型工廠），生活區（供研究所人員平日住宿生活的區域）。除此之外，在研究所外，向西二十里的地方，還有一片劃歸研究所的荒地，這地方是用來進行一些必要的，具有危險性的實驗所用，比如說武器軍械等等，這些東西的實驗在研究所內危險性極大，而且有許多不控因素，所以再設定一個專門的外至區域是必不可少的。

研究所的當家人當然是剛剛歸京的黃履莊，為了保證研究所的獨立性，朱怡成前些天新設了一個機構，這機構名為工科司，工科司主官為工科使，正四品官銜。黃履莊也從工部主事直接調任工科使，同時也升了官。

從六品主事直接升任四品，黃履莊等於升了四級，這也算是對於他在寧波工作成績的表彰。至於工科司，直屬於朝廷，同時獨立於六部以外，由皇室和軍機處直接統屬。

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