基因武器是指利用基因工程技術研製的新型生物戰劑，又稱作第三代生物戰劑，是現代新概念武器的又一發展方向。

基因武器運用先進的遺傳工程技術，用類似工程設計的辦法按人們的需要透過基因重組，然後在一些致病細菌或病毒中接入能對抗普通疫苗或藥物的基因，或者在一些本來不會致病的微生物體內接入致病基因而製造成生物武器。

尤其合成生物學的發展，可實現人工設計與合成自然界並不存在的生物或病毒。

它能改變非致病微生物的遺傳物質,使其產生具有顯著抗藥性的致病菌，利用人種生化特徵上的差異，使這種致病菌只對特定遺傳特徵的人們產生致病作用，從而有選擇地消滅敵方有生力量。

所以在軍事領域，基因工程是一種可以使一個種族滅絕的超級武器。

因為人的任何形態都反映了他的基因，因此用基因武器殺人，可以達到滅絕種族的目的。

比如說用特定的基因武器可以殺死所有紅褐色頭髮的人，也可以只殺矮個子或高個子，藍眼睛或黑眼睛的人。

比如某些國家就在準備製造“種族變異病毒”，透過對具有群體遺傳特點的人體細胞、組織器官和機體系統，施加目標明確的化學或生物影響，使基因密碼出現差錯，從而達到殺人的目的。

而且神不知鬼不覺，別認為以為是自身的原因，或某種自然狀況。

如果不特定種群，只要求殺傷力，只要將毒性明顯的基因材料匯入細菌病毒或人的病毒可以取得能在短期內使大量人員死亡的細菌武器。

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